Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd1P33215 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms