Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxc11P31313 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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