Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprmP28828 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprmP28828 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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