Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Dusp1P28563 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms