Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6aP27664 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms