Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms