Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CftrP26361 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CftrP26361 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CftrP26361 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CftrP26361 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms