Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctnna1P26231 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ctnna1P26231 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms