Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb7P26011 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms