Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms