Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrkcaP20444 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms