Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NefhP19246 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NefhP19246 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NefhP19246 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms