Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rps6ka1P18653 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rps6ka1P18653 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms