Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms