Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Spi1P17433 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms