Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pou4f1P17208 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms