Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcna1P16388 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcna1P16388 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms