Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FosbP13346 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FosbP13346 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FosbP13346 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FosbP13346 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms