Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calb1P12658 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms