Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms