Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Tnp1P10856 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms