Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P10404 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
P10404 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
P10404 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P10404 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms