Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ly6c1P0CW02 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ly6c1P0CW02 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms