Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LtaP09225 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LtaP09225 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LtaP09225 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LtaP09225 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LtaP09225 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtaP09225 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtaP09225 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtaP09225 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtaP09225 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtaP09225 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LtaP09225 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms