Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TtrP07309 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TtrP07309 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TtrP07309 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TtrP07309 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TtrP07309 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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TtrP07309 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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TtrP07309 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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TtrP07309 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TtrP07309 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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TtrP07309 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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TtrP07309 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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TtrP07309 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TtrP07309 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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TtrP07309 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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