Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01878 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01878 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01878 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01878 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms