Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CopeO89079 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CopeO89079 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CopeO89079 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CopeO89079 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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