Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BlmO88700 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BlmO88700 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BlmO88700 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BlmO88700 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BlmO88700 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BlmO88700 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BlmO88700 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BlmO88700 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BlmO88700 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BlmO88700 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BlmO88700 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BlmO88700 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BlmO88700 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms