Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp4O70480 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms