Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx4O55187 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms