Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cldn5O54942 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn5O54942 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn5O54942 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn5O54942 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn5O54942 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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