Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb3O54890 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb3O54890 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itgb3O54890 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itgb3O54890 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms