Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DffaO54786 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
DffaO54786 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
DffaO54786 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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