Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdc4O35988 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc4O35988 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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