Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FxnO35943 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FxnO35943 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms