Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LhbO09108 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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LhbO09108 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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LhbO09108 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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LhbO09108 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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LhbO09108 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LhbO09108 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LhbO09108 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms