Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EllO08856 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EllO08856 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EllO08856 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EllO08856 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EllO08856 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EllO08856 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EllO08856 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EllO08856 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
EllO08856 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EllO08856 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms