Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MttpO08601 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MttpO08601 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MttpO08601 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MttpO08601 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MttpO08601 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MttpO08601 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MttpO08601 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MttpO08601 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MttpO08601 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MttpO08601 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MttpO08601 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MttpO08601 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MttpO08601 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MttpO08601 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MttpO08601 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MttpO08601 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MttpO08601 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MttpO08601 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms