Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm6871L7N248 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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