Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm379J3QQ19 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm379J3QQ19 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm379J3QQ19 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms