Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm27195-201ENSMUST00000184283 681 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm20852-202ENSMUST00000188011 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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