Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim18J3QNP2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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