Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm3415J3QMS8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm3415J3QMS8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm3415J3QMS8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm3415J3QMS8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm3415J3QMS8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm3415J3QMS8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm3415J3QMS8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm3415J3QMS8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3415J3QMS8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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