Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17535J3KMR8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms