Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm20830J3KML6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm20830J3KML6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm20830J3KML6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20830J3KML6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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