Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf4bG5E8Z2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf4bG5E8Z2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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