Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Arfgef1G3X9K3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms