Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp9yF8VPU6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms