Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Urb2E9Q7L1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms