Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm17175E9Q528 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm17175E9Q528 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm17175E9Q528 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm17175E9Q528 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm17175E9Q528 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm17175E9Q528 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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